Ганкирин

Encyclopedia of Cancer, Springer-Verlag, 2017


Синоним

PSMD10

Определение

Ганкирин (Gann ankyrin-repeat protein, «Gann» по-японски означает рак) представляет собой 25kD небольшой протеин из 226 аминокислот, первоначально идентифицированный как продукт онкогена, обычно гиперэкспрессируемого в гепатоцеллюлярной карциноме человека (HCC). Независимо, он очищаетя как p28 компонент 19S регулятора (PA700 комплекс) 26S протеасомы. Ген локализуется на Xq22.3 хромосоме человека и продуцирует, по меньшей мере, девять вариантов транскриптов, кодирующих девять различных протеинов. Ганкирин ассоциируется с циклин-зависимой киназой 4 (CDK4) для контроля фосфорилирования ретинобластомного протеина pRB и с E3 убиквитин-лигазой MDM2 для контроля убиквитиляции и деградации p53 (и, возможно, pRB).

Характеристика

Ганкирин — небольшой транслокационный протеин между цитоплазмой и ядром, который сохраняется на протяжении всей эволюции (~ 40% идентичности с Nas6p дрожжами). Структурно ганкирин состоит из семи, а не пяти или шести, как первоначально предполагалось по его аминокислотной последовательности, анкириновых повторов (рис.1). Анкириновый повтор — функциональный домен, вовлеченный в протеин-протеиновые взаимодействия, и ганкирин взаимодействует со множественными протеинами, включая S6b АТФ-азу (также известную как Rpt3, TBP7 или PSMC4) 19S регулятора 26S протеасомы.

Фигура 1. Структура ганкирина. Цепочка полипептида окрашена от ее N-конца синим до С-конца красным. ANK1-7 показывает семь анкириновых повторов